在Windows中，MySQL 5.1的默認安裝目錄是C:Program FilesMySQLMySQL Server 5.1。(一些Windows用戶寧愿安裝到原來的默認安裝目錄 C：mysql。然而，子目錄布局仍然相同）。安裝目錄包括以下子目錄：
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目錄 |
目錄內容 |
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bin |
客戶端程序和mysqld服務器 |
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data |
日志文件，數據庫 |
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Docs |
文檔 |
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examples |
示例程序和腳本 |
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include |
包含(頭)文件 |
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lib |
庫 |
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scripts |
實用工具腳本 |
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share |
錯誤消息文件 |
使用MySQL AB's Linux RPM分發進行安裝后，將在以下系統目錄產生文件：
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目錄 |
目錄內容 |
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/usr/bin |
客戶端程序和腳本 |
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/usr/sbin |
mysqld服務器 |
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/var/lib/mysql |
日志文件，數據庫 |
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/usr/share/doc/packages |
文檔 |
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/usr/include/mysql |
包含(頭)文件 |
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/usr/lib/mysql |
庫 |
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/usr/share/mysql |
錯誤消息和字符集文件 |
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/usr/share/sql-bench |
基準程序 |
在Unix中，可以在你選擇的安裝位置解壓并安裝tar文件二進制分發(typically /usr/local/mysql)并在該位置創建以下目錄：
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目錄 |
目錄內容 |
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bin |
客戶端程序和mysqld服務器 |
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data |
日志文件，數據庫 |
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docs |
文檔，ChangeLog |
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include |
包含(頭)文件 |
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lib |
庫 |
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scripts |
mysql_install_db |
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share/mysql |
錯誤消息文件 |
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sql-bench |
基準程序 |
配置并編譯完源碼分發后，便開始安裝。默認情況下，可以將文件安裝到/usr/local，即在下面的子目錄中：
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目錄 |
目錄內容 |
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bin |
客戶端程序和腳本 |
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include/mysql |
包含(頭)文件 |
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info |
Info格式的文檔 |
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lib/mysql |
庫 |
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libexec |
mysqld服務器 |
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share/mysql |
錯誤消息文件 |
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sql-bench |
基準程序和crash-me測試 |
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var |
數據庫和日志文件 |
在一個安裝目錄內，源碼安裝的布局在下列方面不同于二進制安裝：
· mysqld服務器被安裝在“libexec”目錄而不是“bin”目錄內。
· 數據目錄是“var”而非“data”。
· mysql_install_db被安裝在“bin”目錄而非“scripts”內。
· 頭文件和庫目錄是“include/mysql”和“lib/mysql”而非“include”和“lib”。
執行源碼分發根目錄下的scripts/make_binary_distribution腳本，你可以用編譯過的源碼分發版創建你自己的二進制安裝。